144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4475 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  99.72 
 
 		 359 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  100 
 
 		 359 aa  731    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  44.13 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  36.31 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  34.38 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  30 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  30 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  30 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  30 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  30 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  30 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  29.41 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  34.89 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  27.12 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  25.93 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  26.36 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  26.36 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  26.53 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  21.53 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  22.44 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0383  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.823636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  23.77 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2021  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.159835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  19.23 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  22.98 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  25.21 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  25.21 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29500  putative type II secretion system protein  30.19 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0932  type II secretion system protein  22.41 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  0.0185308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  25.76 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  19.31 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  22.48 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0317  general secretion pathway protein F  33.6 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.47036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  21.02 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  18.34 
 
 		 404 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  20.96 
 
 		 453 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  22.87 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  22.66 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  20.81 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  25.69 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  27.32 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  22.16 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  18.16 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  22.7 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  22.71 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  21.75 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  22.43 
 
 		 413 aa  50.1  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  18.59 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  20.82 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  22.38 
 
 		 404 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  25.28 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  21.88 
 
 		 404 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  21.45 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  23.27 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  22.87 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  25.83 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  22.1 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  24.22 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  22.47 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  26.04 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  24.3 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02971  general secretion pathway GSPF-like transmembrane protein  34.56 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  22.06 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  24.86 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  22.42 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00171  pili biogenesis protein  23.6 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  18.86 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  18.86 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  18.86 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  30.67 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  18.86 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  29.1 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  20.29 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  24.65 
 
 		 403 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1811  pilus biogenesis protein, putative  22.22 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.620697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  19.55 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  20.58 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  17.34 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  26.38 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  22.64 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  18.5 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.38 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  21.96 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  20.29 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  20.41 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  24.63 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  24.65 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1048  general secretion pathway protein F  30.06 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  26.95 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00345  putative general secretion pathway GSPF-related transmembrane protein  25.08 
 
 		 397 aa  46.2  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.604529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>