More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0383 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0383  type II secretion system protein  100 
 
 
411 aa  793    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.823636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  38.41 
 
 
413 aa  298  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  41.18 
 
 
405 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  40.93 
 
 
405 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  41.42 
 
 
408 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  38.7 
 
 
406 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 
407 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 
407 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 
407 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 
407 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  40.2 
 
 
408 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
407 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  40.2 
 
 
405 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  37.5 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  38.89 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  38.39 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  39.61 
 
 
405 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  37.86 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  37.44 
 
 
410 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  40.69 
 
 
403 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 
407 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 
407 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  38.69 
 
 
407 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
407 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  41.67 
 
 
408 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  35.05 
 
 
405 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
405 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  36.5 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  40.59 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  38.69 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  41.06 
 
 
403 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  38.24 
 
 
405 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  40.73 
 
 
405 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  40.49 
 
 
405 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  40.68 
 
 
403 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  39.13 
 
 
404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  35.44 
 
 
406 aa  270  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  37.9 
 
 
405 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  37.9 
 
 
405 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  40.44 
 
 
403 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  37.71 
 
 
407 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  39.71 
 
 
405 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  39.27 
 
 
408 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  35.35 
 
 
399 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  37.47 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  40.24 
 
 
407 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  36.5 
 
 
405 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  34.8 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  40.69 
 
 
407 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  38.88 
 
 
407 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  39.71 
 
 
405 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  38.63 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  38.48 
 
 
407 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.750263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  38.48 
 
 
407 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  38.48 
 
 
407 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  37.75 
 
 
405 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  38.24 
 
 
407 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
399 aa  256  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  38.14 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  40.44 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  38.14 
 
 
403 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  33.82 
 
 
404 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  40.44 
 
 
405 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  35.8 
 
 
398 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  35.8 
 
 
398 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  35.8 
 
 
398 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  35.8 
 
 
398 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  35.8 
 
 
398 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  36.3 
 
 
403 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  35.84 
 
 
409 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  38.63 
 
 
404 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  36.43 
 
 
404 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  38.63 
 
 
404 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  38.97 
 
 
405 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  30.73 
 
 
400 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  38.67 
 
 
400 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  30.24 
 
 
400 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  37.07 
 
 
400 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.86 
 
 
401 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 
411 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  30.24 
 
 
400 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  37.25 
 
 
401 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  36.1 
 
 
411 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  31.85 
 
 
405 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  35.44 
 
 
403 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  36.41 
 
 
409 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  35.05 
 
 
411 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  36.08 
 
 
408 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.86 
 
 
405 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>