25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3701 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  837    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  24.53 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  23.86 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  22.47 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  25.19 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  26.2 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  26.2 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  26.2 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  26.2 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  26.2 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  26.2 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  25.46 
 
 		 358 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  21.85 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  20.09 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  21.26 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  20.41 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  27.89 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  21.14 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  25 
 
 		 404 aa  46.6  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  24.77 
 
 		 361 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>