32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5556 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  100 
 
 
377 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  76.92 
 
 
377 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  24.53 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  24.48 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  23.93 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  23.18 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  25.23 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  25.23 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  21.38 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  21.38 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  23.19 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  21.4 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4495  hypothetical protein  23.85 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  22.29 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  24.35 
 
 
358 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  22.47 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  20.52 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  21.25 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  20.95 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  23.48 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  23.48 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  23.48 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  23.48 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  23.48 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  21.28 
 
 
357 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  23.48 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  19.2 
 
 
340 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  21.22 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  21.46 
 
 
411 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  20.2 
 
 
361 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  21.29 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  19.77 
 
 
363 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>