More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1585 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1585  type II secretion system protein  100 
 
 		 398 aa  786    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0451652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1279  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3008  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2108  type II secretion system protein  36.66 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0740  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0911  type II secretion system protein  32.03 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.544826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2612  putative general secretion pathway protein F  32.77 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  26.65 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  27.64 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.04 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  23.72 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3408  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  26.68 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  24.74 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  25.21 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  24.93 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  24.94 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1793  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  24.17 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  25.4 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  24.94 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  26.98 
 
 		 401 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2022  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.253546  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  25.95 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  24.94 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  26.87 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  24.36 
 
 		 463 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  24.94 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  27.13 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  29.89 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  25.73 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  27.1 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  28.01 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  24.25 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  24.25 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 427 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  27.14 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  25.8 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  26.44 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  27.08 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  27.23 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  25.07 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  25.95 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  25.38 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  26.85 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0580  type II secretion system protein  24.15 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000819628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  24.81 
 
 		 424 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  24.93 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  25.67 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  24.47 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  26.94 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  26.73 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  24 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  24.18 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_002620  TC0859  general secretion pathway protein F  26.22 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  23.08 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  22.82 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  24.93 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  25.6 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  25.14 
 
 		 396 aa  116  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>