More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2612 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2612  putative general secretion pathway protein F  100 
 
 		 389 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0740  type II secretion system protein  65.81 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1279  general secretion pathway protein F  62.27 
 
 		 403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3008  type II secretion system protein  60.93 
 
 		 403 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0911  type II secretion system protein  53.98 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.544826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2108  type II secretion system protein  55.27 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1793  type II secretion system protein  35.9 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2022  type II secretion system protein  34.97 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.253546  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1585  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0451652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  28.09 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  27.51 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  27.84 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  26.3 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  27.43 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.97 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  27.51 
 
 		 405 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  27.95 
 
 		 406 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  27.95 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  27.57 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  31.06 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  27.18 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  31.04 
 
 		 410 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  27.11 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  25.99 
 
 		 419 aa  149  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  27.62 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  27.62 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  27.62 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  27.62 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  28.02 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  31.74 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  27.73 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  27.43 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 409 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.65 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 422 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  27.25 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  30 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  29.74 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  29.74 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  29.74 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  25.89 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  29.74 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  29.74 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  26.61 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.18 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  24.42 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  27.51 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  27.6 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.07 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  27.38 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  25.59 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  27.44 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  27.62 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  27.62 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  27.62 
 
 		 407 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  30.18 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 408 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  27.46 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 405 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 420 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.66 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  27.92 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  32.64 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  31.47 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  32.74 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.68 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0547  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171989  normal  0.0556866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  28.68 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  27.44 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  28.97 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  27.79 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  26.84 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  28.43 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  26.65 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  24.93 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  25.66 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  25.65 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 404 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>