122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0761 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  89.97 
 
 		 369 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  100 
 
 		 353 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  89.55 
 
 		 354 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  89.55 
 
 		 354 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  85.21 
 
 		 365 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  86.87 
 
 		 356 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  84.76 
 
 		 359 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  85.84 
 
 		 346 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  71.63 
 
 		 348 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  69.04 
 
 		 361 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  70.47 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  69.25 
 
 		 353 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  64.33 
 
 		 342 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  66.38 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  67.6 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  64.19 
 
 		 347 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  53.41 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  53.42 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  53.8 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  53.8 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  54.08 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  52.17 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  54.5 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  53.41 
 
 		 354 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  50.82 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  50.82 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  52.1 
 
 		 347 aa  352  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  52.1 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  49.86 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  50.28 
 
 		 351 aa  332  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  44.81 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  33.52 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  33.33 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  33.6 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  33.33 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  32.65 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  32.49 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.07 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  30.64 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  31.46 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  30.47 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  31.58 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  31.91 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  30.23 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  30.65 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  31.58 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  31.58 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.72 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  29.81 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  28.81 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  26.54 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  28.31 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  26.92 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.3 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  29.01 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  29.39 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  29.69 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  25.35 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  24.93 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  26.48 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  24.36 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  22.29 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  23.67 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  25 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  25.13 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  27.68 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  30.11 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  26.81 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  26.81 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  26.81 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  22.47 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  24.58 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  27.04 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  25.82 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  27.67 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  27.04 
 
 		 358 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  29.38 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  29.38 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  29.38 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  29.38 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  29.38 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  29.38 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  29.38 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1463  porin  32.84 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000881778  normal  0.0418658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  26.32 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  24.92 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  26.32 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  25.39 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  24.92 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  28.86 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  26.64 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  26.64 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  28.86 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  24.68 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  26.22 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  27.07 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  24.84 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  25.88 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  26.22 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>