128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4151 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4151  porin  100 
 
 		 348 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  77.36 
 
 		 342 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  73.52 
 
 		 342 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  73.93 
 
 		 346 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  76.14 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  74.64 
 
 		 342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  71.63 
 
 		 353 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  72.11 
 
 		 347 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  69.09 
 
 		 369 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  70.22 
 
 		 356 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  70.03 
 
 		 354 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  70.03 
 
 		 354 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  68.8 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  67.39 
 
 		 361 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  67.66 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  65.18 
 
 		 353 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  55.25 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  55.8 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  57.46 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  56.75 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  54.97 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  53.78 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  55.8 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  56.08 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  56.08 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  56.08 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  54.49 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  54.49 
 
 		 372 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  55.4 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  53.17 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  45.07 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  35.99 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  36.76 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  36.07 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  36.96 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  37.82 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  33.04 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  32.21 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  32.22 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  31.91 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  32.22 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  32.3 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.47 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  32.22 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  32.22 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  31.64 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  31.61 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  31.37 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  30.17 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  30.45 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  31.13 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  28.33 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  28.45 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  28.57 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  28.53 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  29.3 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  28.09 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  29.49 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  32.27 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  25.6 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  24.34 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  24.44 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  25.16 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  24.14 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  25.54 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  27.44 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  25.96 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  24.74 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  24.03 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  24.79 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  30.07 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  25.53 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  25.07 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  22.29 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  29.07 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  32.43 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  27.45 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1463  porin  31.82 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000881778  normal  0.0418658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  27.73 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  28.65 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  24.37 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  25.64 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  28.38 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0572  outer membrane protein, putative porin  21.84 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  27.65 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  27.65 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  27.65 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  27.65 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  27.65 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  27.65 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  27.65 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  26.63 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  28.24 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  26.32 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  34.18 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  26.32 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  34.18 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  26.32 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  24.34 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  24.73 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>