111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2092 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2092  porin  100 
 
 		 346 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  76.3 
 
 		 346 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  67.72 
 
 		 349 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  67.34 
 
 		 345 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  64.31 
 
 		 351 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  40.44 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  41.44 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  39.23 
 
 		 355 aa  225  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  40.33 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  40.77 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  40.33 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  40.33 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  40.06 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  39.89 
 
 		 354 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  40.17 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  39.78 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  37.87 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  36.44 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  35.03 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  32.3 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  36.67 
 
 		 342 aa  189  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  35.91 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  34.82 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  35.81 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  37.16 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  34.65 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  35.81 
 
 		 372 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  35.31 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  36.76 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  34.31 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  33.51 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  34.76 
 
 		 359 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  32.61 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  32.72 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  32.64 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  30.77 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  29.86 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  28.96 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  30.46 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  31.17 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  30.46 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  30.46 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  30.46 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  30.46 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  30.46 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.31 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  30.46 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  30.33 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  29.55 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  28.44 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  26.59 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  29.33 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  29.03 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  28.26 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  26.04 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  25.63 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  26.62 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  23.21 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  25.5 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  23.35 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  23.27 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  24.88 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  24.88 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  24.88 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  24.88 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  23.92 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  25.07 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  24.4 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  29.48 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  24.88 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  25.12 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  26.51 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  26.83 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000136886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  22.25 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  26.33 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  23.98 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  24.71 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01269  hypothetical protein  29.86 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  25.46 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  27.27 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  25.21 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  23.81 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  24.82 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  22.13 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  22.13 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  22.13 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  22.13 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  22.13 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  22.13 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  22.13 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  26.15 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0572  outer membrane protein, putative porin  22.87 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  25.32 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  24.54 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  25 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  25 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  25 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  25 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  25 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>