176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0773 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
333 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000136886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  34.38 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  33.07 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  26.18 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  25.46 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  25.08 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  24.91 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  25.08 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  25.26 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  24.75 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  25.76 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  32.31 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  29.03 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  27.18 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  27.65 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  27.65 
 
 
314 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  30.3 
 
 
383 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  29.02 
 
 
381 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  23.08 
 
 
314 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  23.08 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  24.47 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  26.57 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  29.8 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  25.25 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  27.01 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 
382 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  27.31 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  27.5 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  26.03 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  27.31 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  27 
 
 
383 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  25.72 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  26.34 
 
 
380 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  28.64 
 
 
392 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  24.36 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  26.29 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  27.23 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  26.02 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  30.36 
 
 
374 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  28.51 
 
 
381 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  27.78 
 
 
379 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  30.1 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  26.19 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  26.67 
 
 
372 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  23.77 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  23.67 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  25.55 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  26.25 
 
 
481 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  26.32 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  27.68 
 
 
381 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  23.02 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  26.91 
 
 
347 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  26.29 
 
 
396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  28.44 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  26.85 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  26.32 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  26.96 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  22.92 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  25.62 
 
 
368 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  25.19 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  25 
 
 
383 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  24.65 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  25.11 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  25.86 
 
 
347 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  25.35 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  25.11 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  21.76 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  26.3 
 
 
385 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  24.22 
 
 
365 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  26.75 
 
 
355 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  26.77 
 
 
379 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  23.89 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  26.3 
 
 
385 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  27.16 
 
 
381 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  27.23 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  25.88 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  26.77 
 
 
379 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  26.77 
 
 
379 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  26.77 
 
 
379 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  26.77 
 
 
379 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  27.36 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  26.56 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  26.24 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  26.73 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  21.88 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  26.04 
 
 
394 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  27.84 
 
 
376 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  27.04 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  23.47 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  25 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  25 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  25 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  25 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  27.63 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004186  membrane protein  24.74 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.920547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  21.88 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  23.98 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  25.68 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  24.62 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  23.28 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>