67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3847 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3847  porin  100 
 
 		 354 aa  721    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  60.45 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  50.97 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  50.42 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  50.69 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  50.42 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  49.16 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  35.05 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  32.97 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2545  porin  33.33 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  34.87 
 
 		 348 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  34.54 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  32.78 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1259  porin  34.9 
 
 		 386 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2365  porin  29.81 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  29.46 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  25.47 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  25.43 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  25.32 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  27.95 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  25.75 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  26.82 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  26 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  23.29 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  22.48 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  27.06 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  25 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  24.32 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0162  outer membrane protein OmpU  25.91 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502396  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  28.77 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  24.09 
 
 		 331 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  25.74 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  32.62 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  26.01 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  25.65 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  29.8 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  23.88 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  26.55 
 
 		 385 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  26.79 
 
 		 316 aa  46.2  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0904  porin  23.98 
 
 		 360 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.3308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  25 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  23.75 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  30.89 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3613  porin  23.3 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1445  ompT protein  24.85 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000193384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  25 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  25 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  25 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  25 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  25 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  25 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  25 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  25.43 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1814  Outer membrane protein (porin)-like protein  36.49 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000274803  hitchhiker  0.000000000255936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  25.43 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  27.83 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  27.15 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  26.78 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  30.63 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  25 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000136886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  27.27 
 
 		 402 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000711113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0971  putative outer membrane protein  23.64 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  31.93 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  33.64 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  26.36 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>