67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0640 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3752  porin  98.31 
 
 		 355 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  98.87 
 
 		 355 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  100 
 
 		 355 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  99.15 
 
 		 355 aa  717    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  79.15 
 
 		 350 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  50.42 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  47.38 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  36.26 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  39.14 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2545  porin  38.35 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2365  porin  34.44 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  35.16 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  36.33 
 
 		 348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  36.33 
 
 		 348 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1259  porin  38.78 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042009 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  26.64 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  25.5 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  30.94 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  27.11 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  27.37 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  24.73 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  31.87 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  27.89 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  26.59 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  26.46 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  25.74 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  25 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.58 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  39.77 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  24.14 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  24.3 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0162  outer membrane protein OmpU  31.86 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  28.77 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  36.04 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  38 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  32.05 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  28.1 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.66 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  25.56 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  25.56 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  25.56 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2781  hypothetical protein  37.14 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000711113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  26.6 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  32.35 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  23.91 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  35 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  24.66 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  29.79 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  25.2 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  24.04 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  30.81 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3613  porin  23.51 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  27.78 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  26.14 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  23.26 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  28.49 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  27.86 
 
 		 413 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0301  porin  25.11 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419349  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  31.34 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>