More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2050 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2050  porin  100 
 
 		 376 aa  759    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  32.98 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  31.69 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  30.53 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  27.4 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  29.65 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  26.02 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  26.98 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  27.63 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  25.13 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  29.12 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  27.66 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  28.85 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  27.41 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  25.75 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  26.15 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  26.39 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  27.55 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  26.8 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  25.74 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  25.67 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  25.89 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  27.46 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  26.18 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  25.41 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  25.19 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  26.74 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  26.96 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  25.37 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  27.95 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  27 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  22.75 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  24.25 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  26.55 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  29.46 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  24.28 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  25.33 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  24.6 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  25.27 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  25.68 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  25.38 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  25.07 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  23.39 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  26.38 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  25.64 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  26.2 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  26.15 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  26.36 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  26.15 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  25 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  26.15 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  25.4 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  26.21 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  25.24 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  26.08 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  27.51 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  34.88 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  24.46 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  25.21 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  29.1 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  26.11 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  24.68 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  31.01 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  24.68 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  31.21 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  30.5 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  26.75 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  28.21 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  23.21 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  24.68 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  24.68 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  31.21 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  25.39 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  26.96 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  24.6 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  24.27 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  26.69 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  26.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  28.21 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  23.56 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  25.58 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  29.1 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  23.89 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  26.87 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  24.46 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  23.77 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  25.13 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  25.3 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  29.68 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  21.73 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  25 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  24.37 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  26.69 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  26.46 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  26.76 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  23.91 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  23.93 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  23.96 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  26.59 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  23.83 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>