171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0821 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0821  porin  100 
 
 
365 aa  726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  94.52 
 
 
354 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  94.52 
 
 
354 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  84.82 
 
 
369 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  85.21 
 
 
353 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  82.47 
 
 
346 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  78.38 
 
 
356 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  76.68 
 
 
359 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  69.86 
 
 
361 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  67.66 
 
 
348 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  67.12 
 
 
342 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  66.67 
 
 
353 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  63.11 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  65.04 
 
 
344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  62.4 
 
 
347 aa  441  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  60.33 
 
 
342 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  55.11 
 
 
352 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  54.28 
 
 
354 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  52.94 
 
 
354 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  52.94 
 
 
354 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  52.94 
 
 
354 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  52.41 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  52.41 
 
 
354 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  51.07 
 
 
354 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  50.14 
 
 
347 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  50.14 
 
 
372 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  49.6 
 
 
354 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  49.74 
 
 
355 aa  346  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  49.33 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  49.86 
 
 
351 aa  332  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  44.48 
 
 
338 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  34.31 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  33.24 
 
 
351 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  32.89 
 
 
345 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  35.13 
 
 
342 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  32.89 
 
 
349 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  32.6 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.53 
 
 
314 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  31.53 
 
 
314 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  31.07 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  31.21 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  29.38 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  30.89 
 
 
313 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  30.89 
 
 
314 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  30.89 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  30.89 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.13 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  28.75 
 
 
314 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  26.68 
 
 
316 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  28.57 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  29.11 
 
 
314 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  27.78 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  26.4 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  24.93 
 
 
340 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  26.15 
 
 
302 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  30.43 
 
 
362 aa  85.9  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  27.93 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  26.6 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  29.32 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  25.91 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  24.59 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  24.12 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  23.53 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  26.04 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  24.38 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  25.31 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  25.71 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  21.02 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  24.39 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  24.39 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  24.39 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  25.88 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  24.39 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  24.39 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  24.39 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  28.92 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  24.39 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  30.7 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  25 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  32.68 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  26.07 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  25.98 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  25.98 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  25.98 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  26.85 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  27.06 
 
 
385 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  25.98 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  25.98 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  26.85 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  26.85 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  26.8 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  29.38 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  26.81 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  27.06 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  26.81 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  28.75 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  27.06 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  28.75 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  28.12 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  28.12 
 
 
368 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.537681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>