222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2569 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2569  porin  100 
 
 		 365 aa  723    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  35.75 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  32.82 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000136886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  31.58 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  31.58 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  31.58 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  31.58 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  31.58 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  31.42 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  31.42 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  31.33 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  29.19 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  29.19 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  29.87 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  29.19 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  29.19 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2056  porin Gram-negative type  28.72 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  26.47 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  26.39 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  25.5 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  28.53 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  24.93 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  25.86 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  26.33 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  26.18 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  29.94 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  25.61 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  30.14 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  24.72 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  27.93 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  25.61 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  28.16 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  26.78 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  27.45 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  27.45 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  27.45 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  25.21 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  25.37 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  27.21 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  25.54 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  28.71 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  27.51 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  28.49 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  25.6 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  27.01 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  28.79 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  25.35 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  37.7 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  26 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  28.06 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  25.89 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  28.06 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  25.89 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  28.06 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  25.6 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  25.89 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  28.06 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  25.35 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  26.67 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  26.82 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  26.82 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  25.6 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  26.82 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  26.82 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1666  porin Gram-negative type  28.06 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000017605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  37.7 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  27.74 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  25.58 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  25.67 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  25.67 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  25.97 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  25.67 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  25.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  25.08 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  29.22 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  25.4 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  26.79 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  23.56 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  23.56 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  23.75 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  24.29 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  28.76 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  25.58 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  30.3 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  25.79 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  23.56 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  23.56 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  23.56 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  23.56 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  27.57 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  23.56 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  27.25 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  33.06 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  33.06 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>