186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1097 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  99.72 
 
 
363 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  99.72 
 
 
363 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  99.72 
 
 
363 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  99.72 
 
 
363 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  100 
 
 
363 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  69.62 
 
 
368 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  58.54 
 
 
362 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  58.54 
 
 
362 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  58.54 
 
 
362 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  57.99 
 
 
362 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  58.54 
 
 
362 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  57.99 
 
 
362 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  58.54 
 
 
362 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  58.27 
 
 
362 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  56.91 
 
 
357 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  56.79 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  57.34 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  55.56 
 
 
383 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  55.59 
 
 
362 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  55.59 
 
 
362 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  55.59 
 
 
362 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  57.82 
 
 
369 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  55.59 
 
 
362 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  54.4 
 
 
364 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  54.59 
 
 
360 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  55.87 
 
 
378 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  54.01 
 
 
363 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  55.01 
 
 
360 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  52.66 
 
 
370 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  56.07 
 
 
383 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  53.7 
 
 
367 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  53.66 
 
 
359 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  53.17 
 
 
368 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  52.91 
 
 
367 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  55.16 
 
 
351 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  53.65 
 
 
378 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  55.56 
 
 
383 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  52.76 
 
 
387 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  54.64 
 
 
351 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  52.07 
 
 
376 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  53.97 
 
 
372 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  55.1 
 
 
388 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  54.92 
 
 
351 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  54.92 
 
 
351 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  54.64 
 
 
351 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  54.92 
 
 
351 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  54.64 
 
 
351 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  51.81 
 
 
376 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  55.44 
 
 
380 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  54.25 
 
 
350 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  53.39 
 
 
378 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  53.12 
 
 
378 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  53.12 
 
 
378 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  53.12 
 
 
378 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  52.25 
 
 
371 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  52.52 
 
 
371 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  52.52 
 
 
371 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  55.59 
 
 
360 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  55.59 
 
 
360 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  55.75 
 
 
345 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  53.15 
 
 
350 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  53.15 
 
 
350 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  55.75 
 
 
345 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  53.15 
 
 
350 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1614  outer membrane protein N  53.65 
 
 
377 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.51983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  53.15 
 
 
350 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1776  outer membrane protein N  54.74 
 
 
372 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728933  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  53.65 
 
 
377 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  54.77 
 
 
360 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  53.65 
 
 
377 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  53.65 
 
 
377 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  53.65 
 
 
377 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  53.65 
 
 
377 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  53.65 
 
 
377 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  53.35 
 
 
398 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  52.83 
 
 
365 aa  362  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  53.35 
 
 
398 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  52.88 
 
 
350 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  52.23 
 
 
373 aa  361  9e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  52.24 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  52.24 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  52.24 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  52.25 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  52.25 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  52.84 
 
 
400 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  51.11 
 
 
403 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  52.33 
 
 
360 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  52.33 
 
 
360 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  52.33 
 
 
360 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  50.66 
 
 
373 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1589  outer membrane porin protein LC  56.11 
 
 
333 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.810656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  51.25 
 
 
372 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  50.97 
 
 
372 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  50.97 
 
 
372 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  50.97 
 
 
372 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  50.97 
 
 
372 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02101  hypothetical protein  50.74 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02142  outer membrane porin protein C  51.56 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1666  porin Gram-negative type  48.97 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000017605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  49.87 
 
 
363 aa  298  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>