151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0024 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  100 
 
 		 350 aa  704    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  55.71 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  27.82 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0818  porin  23.51 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.94844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  28.92 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  27.11 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  27.41 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  25.86 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  27.11 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  26.82 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  32.89 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  27.88 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  26.12 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  26.12 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  26.12 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  26.12 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  29.43 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  32.47 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  23.89 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  25.71 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  27.03 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  24.56 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  27.74 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  33.33 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  25.26 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  28.78 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.41 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  29.19 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  29.19 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  29.19 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  29.19 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  29.19 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  26.15 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  29.19 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  28.02 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  28.02 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  30.13 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2365  porin  32.19 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  28.02 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  29.67 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  30 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  28.36 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  27.87 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  25.45 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  30 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  28.29 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  30.46 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  31.33 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  23.42 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  31.33 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  30.46 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  31.69 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  28.7 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  25.49 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  30.46 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  26.29 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  28.81 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  28.81 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  28.4 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  28.4 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  29.71 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  28.4 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  28.26 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  29.48 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  24.25 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  28.81 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  28.81 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  28.81 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  28.12 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  28.81 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  28.81 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  28.12 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  29.71 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  27.9 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  23.33 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  24.48 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  23.33 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  28.4 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  32.28 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  23.33 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  32.71 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  23.33 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2545  porin  28.85 
 
 		 373 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  28.21 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  23.33 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  26.95 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  31.4 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  31.4 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  31.4 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  32 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  28.77 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  27.07 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  27.07 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  32.28 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  27.07 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  32.28 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  27.39 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  41.56 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  27.07 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  29.65 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>