138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3619 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  100 
 
 		 319 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  35.75 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  33.81 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000136886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.17 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  26.42 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  30.39 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  27.95 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  26.79 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  29.54 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  30.94 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  27.19 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  27.46 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  27.46 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  32.52 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  22.26 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  31.29 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  31.01 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.34 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  31.01 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  31.01 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  26.16 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  31.01 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  27.05 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  25.9 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  32.56 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  32.56 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  24.46 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  24.46 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  27.05 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  32.56 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  27.05 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  28.11 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  27.05 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  27.05 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  27.65 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  27.65 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  27.65 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  27.65 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  26.64 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  27.65 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  26.3 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  25.63 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  28.46 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  25.61 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  25.63 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  25.63 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  25.63 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  24.6 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  27.64 
 
 		 402 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  24.19 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  24.19 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  24.19 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  24.19 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  29.61 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  25.61 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  25.61 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  25.61 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  24.19 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  28.07 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  24.19 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  25.61 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  29.91 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  23.55 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.3 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  33.9 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  30.51 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  24.6 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  28.03 
 
 		 372 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  26.95 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  27.87 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  21.8 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  28.48 
 
 		 367 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  30.33 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  27.92 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  25.07 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  30.3 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  20.75 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  30.25 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  26.14 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  37.19 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0171  porin  26.03 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  26.98 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  26.14 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  26.14 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  23.58 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  31.82 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  26.01 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  26.56 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0120  porin  28.41 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.993505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  23.78 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  26.11 
 
 		 378 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2295  hypothetical protein  35.04 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  26.42 
 
 		 362 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  22.78 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  30.43 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  28.37 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  30.71 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  25.97 
 
 		 403 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  27.81 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  22.93 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>