More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0822 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0822  porin  100 
 
 		 359 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  56.21 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  42.06 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  31.87 
 
 		 365 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  31.87 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  28.85 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  29.19 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  29.53 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  27.86 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  30.38 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  26.58 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  36.81 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  25.54 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  27.37 
 
 		 360 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  26.95 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  28.75 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  27.18 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  26.37 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  27.18 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  26.32 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  26.37 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  29.21 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  29.21 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  29.21 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  29.21 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  29.21 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  29.21 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  26.47 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  27.34 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  29.21 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  25.15 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  28.1 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  28.67 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  28.67 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  26.11 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  27.41 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  27.85 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  27.85 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  23.53 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  27.57 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  27.57 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  25.82 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  26.74 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  25.82 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  26.03 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  28.12 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  29.55 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  27.03 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  29.05 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  28.27 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  24.71 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  26.9 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  29.27 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  26.6 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  26.2 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  27.83 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  27.83 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  29.61 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  27.83 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  30.41 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  27.83 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  30.41 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  26.64 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  27.54 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  27.83 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  27.95 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  25.73 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  28.02 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  28.17 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  25.87 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  26.48 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  26.15 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  32.4 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  26.89 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  26.07 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  27.32 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  24.66 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  26.53 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  30 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  25.66 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  26.21 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  27.99 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  27.3 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  24.62 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  26.1 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  27.88 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  27.82 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  26.21 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  27.99 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  25.86 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  24.84 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  26.25 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  35.44 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  25.86 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  26.25 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  27.72 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  25.95 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  25.96 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  27.95 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  25.08 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>