More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0120 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0120  porin  100 
 
 		 424 aa  833    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.993505  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0119  porin Gram-negative type  76.94 
 
 		 414 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.165551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.12 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  28.18 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  28.19 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  29.73 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  27.67 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  27.43 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  34.63 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  28.19 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  29.17 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  26.53 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  27.96 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  36.92 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  30.1 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  38.14 
 
 		 368 aa  90.5  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.27 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  36.92 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.27 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.27 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  40.71 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  43.36 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.27 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.27 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.27 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  27.27 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.89 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  28.09 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  27.44 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  43.45 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  28.6 
 
 		 377 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.74 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  42.86 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  37.91 
 
 		 375 aa  86.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  28.82 
 
 		 387 aa  86.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  28.07 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  32.63 
 
 		 394 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  28.54 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  32.31 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.18 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  31.78 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  29.84 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  34.69 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  32.82 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.31 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  37.32 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  36.84 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  36.32 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  27.13 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  27.63 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  32.2 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  34.69 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  32.2 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.44 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.44 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  33.17 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  39.87 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  37.32 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  32.03 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  37.32 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  37.86 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  40.56 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  33.17 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  34.69 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  34.18 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  33.75 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  26.53 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  34.69 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  31 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  29.41 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  34.66 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  37.5 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  32.66 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.87 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  28.28 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  33.67 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  32.03 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  32.03 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  38.1 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  33.67 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  34.66 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  33.84 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  26.94 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  27.44 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  30.82 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  27.77 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  28.51 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  29.12 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  39.01 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  37.33 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  29.1 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  28.68 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  27.25 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  27.25 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  27.25 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  27.25 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>