141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1891 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1891  porin  100 
 
 		 349 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  36.07 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  35.38 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  32.35 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  29.68 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  30.68 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  28.37 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.35 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  29.49 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  26.33 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  25.68 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  26.58 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  24.71 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  23.27 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  25.65 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  27.23 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  26.62 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  27.23 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  28.24 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  27.57 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  27.69 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  26.81 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  24.71 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  26.81 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.19 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  26.9 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  27.23 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  25.67 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  26.81 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  27.11 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  27.48 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  29.35 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  26.17 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  26.58 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  23.62 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  23.62 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  26.9 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  25.99 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  25.53 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  25.97 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  23.14 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  25.54 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  32.48 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  24.73 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  24.66 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  25.2 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  26.25 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  25.2 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  25.53 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  25.61 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  25.62 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  25.62 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  25.62 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  32.28 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  28.29 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  25.3 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  27.24 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  30.97 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  25 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  24.2 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  25.31 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  25.9 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  26.98 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  26.75 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  28.78 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  25.51 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  24.39 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  26.46 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  24.92 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  30.83 
 
 		 353 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  27.98 
 
 		 384 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  25.15 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  24.51 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  33.05 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  33.05 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  25.74 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  27 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  32.2 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  26.83 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  27 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  27.38 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1622  Outer membrane protein (porin)-like protein  28.31 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  33.05 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  26.25 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  24.42 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  26.42 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  26.15 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  27.38 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  31.86 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  23.55 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  24.8 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  29.05 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0338  porin  24.02 
 
 		 431 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  26.67 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  27.45 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  28.46 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  24.91 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0350  porin  27.14 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  24.91 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  24.91 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>