145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2038 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2038  porin  100 
 
 		 360 aa  709    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  32.32 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  33.16 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  31.76 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  26.1 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  29.92 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  27.39 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  25.47 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  28.42 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  25.13 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  26.17 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  29.73 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  27.66 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  23.96 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  25.67 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  25.58 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  23.85 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0493  putative porin  33.33 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0108098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  27.41 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  25.61 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  26.63 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  25.33 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  25.93 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  24.81 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  27.48 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  28.95 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  24.44 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  26.56 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  23.69 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  27.55 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  26.34 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  26.28 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  26.13 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  25.07 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  24.31 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  27.65 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  28.57 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  23.39 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  26.32 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  26.32 
 
 		 313 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  26.32 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  23.93 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  23.1 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  26.32 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  26.24 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  23.81 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  23.92 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  24.22 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  24.58 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  25.1 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  29.71 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  25.56 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  29.09 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  25.56 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  25.56 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  25.57 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  24.42 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  22.29 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  28.68 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  25.08 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  26.79 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  29.17 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  25.33 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  24.06 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  23.64 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  33.04 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  23.95 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  29.31 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  33.11 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  24.15 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  26.03 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  25.97 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.68 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.68 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  24.55 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  30.68 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  26.54 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  26.59 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  28.07 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  26.88 
 
 		 396 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  22.79 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  22.79 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  26.4 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  23.26 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  30.68 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  28.57 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.68 
 
 		 449 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  28.42 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  28.57 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.3 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  29.09 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  30.2 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  29.09 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  29.09 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  25.07 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  25.57 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  29.45 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>