More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0593 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0593  porin  100 
 
 		 368 aa  746    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  47.18 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  42.35 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  35.43 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  30.45 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  32.89 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  31.65 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  31.41 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  28.73 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  29.24 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  27.72 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.73 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  26.2 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  35.29 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  27.73 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  28.35 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  26.44 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  32.98 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  27.18 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  25.97 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  28.26 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  29.52 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  28.75 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  26.21 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  28.78 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  25.7 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  23.85 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  27.27 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  30.07 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  25.39 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  25.39 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  26.74 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  26.09 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  25.52 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  24.8 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  25.33 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  26.64 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  28.35 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  25.97 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  26.09 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  24.8 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  28.21 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  26.5 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  28.08 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  25.58 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  29.41 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.74 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  23.29 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  31.74 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  24.42 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  33.33 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  23.12 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  28.08 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  26.01 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  29.11 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  24.04 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  24.42 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  25.5 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  25.21 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  28.83 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  25.47 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  25.47 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  26.69 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  26.32 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.44 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  28.3 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  26.04 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  25.86 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  26.48 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  25.97 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  25 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  24.37 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  24.77 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  27.65 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  28.38 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  24.17 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  30.88 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.56 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  29.54 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  25.68 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  25.41 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  25.68 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  25.97 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  28.88 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  27.18 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  24.65 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  24.5 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  26.84 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  25.07 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  27.11 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  31.72 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  25.17 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  26.08 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  23.5 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  26.6 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  26.32 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  26.6 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  26.32 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  30.56 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  29.17 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>