35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0350 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0350  porin  100 
 
 		 431 aa  865    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0338  porin  98.38 
 
 		 431 aa  854    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  31.9 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  29.48 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  29.6 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  26.9 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  26.7 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  29.01 
 
 		 362 aa  90.5  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  29.35 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  25.47 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  29.5 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  25.21 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  26.77 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  31.95 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  29.89 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  25.15 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  25.15 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  29 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  25.99 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  27.14 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  37.35 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  35.8 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  28.41 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  28.4 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  23.71 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  25.81 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  26.1 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  26.1 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  26.52 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  28.84 
 
 		 341 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  28.57 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  28.57 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  27.76 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  24.36 
 
 		 344 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  35.29 
 
 		 340 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>