98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01269 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004186  membrane protein  91.96 
 
 		 373 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.920547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01269  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  754    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0493  putative porin  36.01 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0108098  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  29.17 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  28.8 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  28.8 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  28.8 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  28.72 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  27.17 
 
 		 523 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  29.26 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  28.1 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  28.19 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  29.47 
 
 		 430 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  31.82 
 
 		 357 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  29.47 
 
 		 430 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  29.47 
 
 		 430 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  29.47 
 
 		 430 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  29.47 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  29.85 
 
 		 388 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  28.72 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  28.19 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.21 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  25.82 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  23.61 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  27.57 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  26.32 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  27.57 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  29.41 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  29.63 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  27.57 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  26.78 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  30.26 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  27.57 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  27.57 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  27.57 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  30.49 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  27.57 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  30.26 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  30.26 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  27.6 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  26.84 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  27.51 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  27.6 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  26.49 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  26.49 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  26.49 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  26.49 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  28.3 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  26.49 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  26.49 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  24.51 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  27.08 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  30.72 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  27.18 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  27.83 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  28.32 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  27.45 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  29.47 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  26.34 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  28.65 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  26.7 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  26.67 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1115  OmpC family outer membrane porin  29.73 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  25.48 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  24.41 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  26.7 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  25.32 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  27.16 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  31.58 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  28 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  32.04 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  24.39 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  24.02 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  26.27 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  26.34 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  26.34 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  31.76 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  25.79 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1114  OmpC family outer membrane porin  29.51 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  26.19 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  26.19 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  27.93 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  24.82 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  28 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  29.7 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  28.89 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  30.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  30.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  30.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  30.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  30.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  30.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  30.77 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  30.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  30.77 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  26.18 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  28.71 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>