More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3838 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  100 
 
 		 386 aa  770    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  91.19 
 
 		 386 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  98.45 
 
 		 386 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  95.08 
 
 		 386 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  98.45 
 
 		 386 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  71.32 
 
 		 386 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  65.03 
 
 		 386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  62.86 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  62.86 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  62.86 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  62.6 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  62.6 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  62.08 
 
 		 386 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  61.22 
 
 		 411 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  61.22 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  61.22 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  61.22 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  61.33 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  62.36 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  61.2 
 
 		 523 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  61.22 
 
 		 384 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  61.22 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  61.22 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  63.19 
 
 		 385 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  63.19 
 
 		 385 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  62.91 
 
 		 385 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  61.11 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  60.44 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  61.07 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  60.71 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  57.37 
 
 		 394 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  60 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  56.19 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  57.22 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  55.7 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  51.9 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  51.83 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  51.88 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  52.17 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  51.57 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  51.9 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  51.9 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  50.78 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  50 
 
 		 390 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  50.78 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  50.78 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  50.39 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  50.39 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  50.39 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  46.42 
 
 		 389 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  48.64 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  46.02 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  46.02 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  45.76 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.07 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.88 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.62 
 
 		 385 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  42.86 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  41.01 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  41.01 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.84 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.09 
 
 		 436 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.25 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  42.09 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  42.71 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  42.71 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  42.71 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  42.71 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  42.71 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  42.09 
 
 		 383 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  42.09 
 
 		 383 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.67 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.74 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.74 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.74 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.74 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.51 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  42.46 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  40.81 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  41.64 
 
 		 445 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40.74 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  40.76 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  41.06 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  41.87 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.91 
 
 		 397 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  42.23 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.25 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  41.07 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  42.48 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  41.44 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6447  porin  40.05 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  40.41 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  39.56 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  37.99 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.62 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  41.23 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5582  porin  40.1 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5946  porin  40.1 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  38.81 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>