More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1114 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1115  OmpC family outer membrane porin  95.82 
 
 		 383 aa  725    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1114  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 383 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  56.4 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  41.85 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  39.22 
 
 		 370 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.2 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.95 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.84 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  40.26 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  40 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  39.74 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  39.41 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  40 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  39.74 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  39.74 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.55 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  41.1 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.4 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.4 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.4 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  40.05 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  39.4 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  39.4 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  40.05 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  40.05 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  40.05 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  40.05 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  39.15 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.94 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.66 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  37.66 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  38.64 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  38.57 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  38.57 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  37.63 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  38.57 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  38.9 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  37.02 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.55 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  39.09 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  38.13 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  37.66 
 
 		 436 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  38.65 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  39.6 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.27 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  37.4 
 
 		 386 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  41.36 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.25 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  38.67 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.48 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  38.7 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38.01 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38.01 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.81 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40.37 
 
 		 380 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.11 
 
 		 389 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  38.61 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.37 
 
 		 380 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.37 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  39.8 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40.37 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  38.15 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.01 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.27 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.91 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  39.41 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  40.74 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  38.73 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  39.24 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  38.73 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.52 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  38.56 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  38.89 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  39.45 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  36.71 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  37.34 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  40.21 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  37.34 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  38.77 
 
 		 386 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  37.34 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  38.46 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  38.46 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  37.92 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  38.46 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  36.59 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  39.27 
 
 		 387 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  37.77 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  39.46 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  37.03 
 
 		 383 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.67 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  38.76 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  39.41 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  39.26 
 
 		 411 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3186  porin  37.27 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  38.05 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  38.05 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>