More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1115 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1115  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 383 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1114  OmpC family outer membrane porin  95.82 
 
 		 383 aa  725    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  55.61 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  42.36 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  38.44 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.2 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.95 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  40.92 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  41.18 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.43 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  41.43 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  41.43 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  41.18 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  40.66 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  38.42 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.29 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  37.26 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.55 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.62 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  40.1 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.72 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  37.72 
 
 		 436 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  38.93 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.25 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  38.15 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.05 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.37 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  38.21 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.11 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  37.88 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  38.21 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  37.15 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  38.21 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  38.21 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  38.21 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  37.47 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  37.35 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40.05 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  37.35 
 
 		 394 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  38.44 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  38.44 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  37.35 
 
 		 394 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  38.44 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  38.44 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  37.63 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  38.44 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  38.07 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.37 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  39.3 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40.11 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.05 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  38.18 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  36.56 
 
 		 378 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40.11 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  37.76 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  37.76 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  38 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  37.76 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.82 
 
 		 375 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  37.92 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  38.54 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  36.63 
 
 		 384 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  38.94 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  38.94 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  38.94 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  38.94 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  37.09 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  38.94 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  38.34 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  36.84 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  36.84 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.27 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  38.94 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  37.56 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.41 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  36.84 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.47 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  37.4 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  38.37 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  39.05 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  35.35 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3186  porin  37.27 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  38.62 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  39.68 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  35.26 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  39.2 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  39.26 
 
 		 411 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.81 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  38.78 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  37.7 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.72 
 
 		 375 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.72 
 
 		 375 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  38.33 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  37.53 
 
 		 398 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  38.31 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4872  porin  37.56 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0644122  normal  0.66467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>