More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6027 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6027  porin  100 
 
 
389 aa  775    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  55.75 
 
 
390 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  55.75 
 
 
390 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  56.45 
 
 
390 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  54.85 
 
 
390 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  54.85 
 
 
390 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  54.85 
 
 
390 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  55.83 
 
 
390 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  53.61 
 
 
390 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  53.87 
 
 
430 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  53.87 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  53.61 
 
 
430 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  53.87 
 
 
430 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  53.61 
 
 
430 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  53.61 
 
 
430 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  53.1 
 
 
386 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  51.93 
 
 
386 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  51.93 
 
 
386 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  51.93 
 
 
386 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  50.91 
 
 
386 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  50.91 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  50.53 
 
 
393 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  53.81 
 
 
387 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  50 
 
 
386 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  50.82 
 
 
385 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  49.86 
 
 
385 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  50.66 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  49.86 
 
 
385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  49.2 
 
 
393 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  50.14 
 
 
411 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  50.14 
 
 
384 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  50.14 
 
 
384 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  50.14 
 
 
430 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  50.14 
 
 
384 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  50.14 
 
 
430 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  50.14 
 
 
384 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  49.05 
 
 
388 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  50.79 
 
 
376 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  50.79 
 
 
376 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  50.41 
 
 
385 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  50.41 
 
 
385 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  50.53 
 
 
376 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  50.14 
 
 
385 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  47.83 
 
 
386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  48.7 
 
 
386 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  47.03 
 
 
523 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  45.24 
 
 
390 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  46.35 
 
 
404 aa  311  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  49.59 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  46.01 
 
 
386 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  46.01 
 
 
386 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  46.59 
 
 
386 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  46.72 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  46.72 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.56 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  44.56 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.56 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.56 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.56 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.3 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  40.51 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.25 
 
 
397 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  39.75 
 
 
397 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.25 
 
 
421 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.25 
 
 
421 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  40 
 
 
397 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  40.48 
 
 
445 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  42.89 
 
 
436 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.63 
 
 
436 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  42.89 
 
 
386 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  42.89 
 
 
386 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  42.89 
 
 
386 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  42.89 
 
 
386 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  42.89 
 
 
386 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  42.63 
 
 
386 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  38.99 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.58 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.32 
 
 
385 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.21 
 
 
389 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  42.51 
 
 
381 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.6 
 
 
383 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.6 
 
 
383 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.8 
 
 
395 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40.62 
 
 
383 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.78 
 
 
383 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  42.72 
 
 
400 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  40.8 
 
 
395 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  37.63 
 
 
389 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  40.37 
 
 
394 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  42.47 
 
 
400 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  39.73 
 
 
395 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  38.85 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  40.27 
 
 
398 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  40.53 
 
 
398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  38.6 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  35.7 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  41.92 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  40.86 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  36.72 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.64 
 
 
389 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>