62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0811 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  100 
 
 		 342 aa  684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  39.16 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  34.76 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  33.91 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  34.1 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  34.39 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  34.1 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  34.42 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  33.82 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  33.72 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  35.84 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  33.43 
 
 		 354 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  34.2 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  33.84 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  34.68 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  35.16 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  35.76 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  31.98 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  35.43 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  33.43 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  33.43 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  35.28 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  35.28 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  35.13 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  32.39 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  32.65 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  32.44 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  34.58 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  33.04 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  32.94 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  30.99 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  30.64 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  30.23 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  31.59 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  30.77 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  32.21 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  31.21 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  31.87 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  30.08 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  31.75 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  29.37 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  30.83 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.02 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  30.43 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  31.08 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  31.08 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  29.47 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  31.08 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  30.94 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  31.08 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  30.66 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.56 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  28.46 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.99 
 
 		 321 aa  99.4  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  28.85 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  24.92 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  23.74 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  33.67 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  30.77 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  23.72 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  23.16 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  25.21 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>