81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0734 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0734  porin  100 
 
 		 354 aa  718    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  95.48 
 
 		 354 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  95.76 
 
 		 354 aa  692    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  82.49 
 
 		 354 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  82.2 
 
 		 354 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  82.2 
 
 		 354 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  82.2 
 
 		 354 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  67.89 
 
 		 354 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  66.95 
 
 		 352 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  65.25 
 
 		 354 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  64.04 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  57.62 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  55.77 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  56.34 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  55.8 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  53.52 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  53.01 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  51.07 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  53.87 
 
 		 346 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  52.17 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  51.45 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  52.47 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  51.9 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  51.9 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  51.07 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  51.49 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  50.14 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  51.95 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  47.41 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  47.41 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  47.34 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  40.87 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  39.17 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  37.71 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  37.6 
 
 		 349 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  33.43 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  36.99 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  29.04 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  27.12 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  28.7 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  28.9 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  29.14 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  28.81 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  29.47 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  29.47 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  28.81 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  29.14 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  26.25 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  29.14 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  27.27 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  28.98 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  26.61 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  26.86 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  27.59 
 
 		 316 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.5 
 
 		 302 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  27.53 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  26.69 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  27.54 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  25.44 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  24.32 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  21.16 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  22.31 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  28.97 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  22.38 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  25.6 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  30.07 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  23.28 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  24.29 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  23.13 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  30.4 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  24.1 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  25.07 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  23.66 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1463  porin  30.71 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000881778  normal  0.0418658 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  27.04 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  23.03 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  25.51 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  30 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  30 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  27.39 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>