More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0468 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 271 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  67.18 
 
 		 266 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  65.27 
 
 		 267 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  65.27 
 
 		 267 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  65.27 
 
 		 267 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  64.89 
 
 		 267 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  64.15 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  64.12 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  64.12 
 
 		 267 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  64.5 
 
 		 267 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  63.74 
 
 		 267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  62.21 
 
 		 262 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  61.83 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  64.12 
 
 		 269 aa  349  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  61.74 
 
 		 264 aa  348  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  59.92 
 
 		 267 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  53.41 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  48.84 
 
 		 260 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  48.46 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  48.84 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  47.67 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  46.9 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  46.9 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  46.9 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  47.29 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  48.84 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  46.9 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  47.67 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  46.51 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  46.9 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  46.9 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  46.15 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  46.51 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  46.51 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  46.51 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  46.39 
 
 		 270 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  46.69 
 
 		 264 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  46.51 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  46.15 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  44.23 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  48.51 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  47.13 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  46.33 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  47.35 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  47.35 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  46.36 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  44.91 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  46.36 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  44.91 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  46.74 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  46.01 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  44.53 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  49.05 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  45.45 
 
 		 267 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  44.7 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  45.08 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  42.69 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  38.78 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  41.7 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  42.25 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  38.87 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  37.79 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  38.08 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.85 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  35 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  32.45 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.88 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  33.96 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  45.91 
 
 		 179 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.47 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  34.88 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  33.58 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  33.98 
 
 		 464 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  33.21 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  32.32 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.06 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  33.47 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.02 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.47 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  32.45 
 
 		 457 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.08 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  31.18 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  30.42 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  32.93 
 
 		 459 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  31.18 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.47 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  30.89 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  32.51 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.69 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  30.83 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  32.08 
 
 		 264 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  31.84 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  33.19 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  32.78 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>