More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3799 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 264 aa  549  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  68.06 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  69.08 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  69.08 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  68.7 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  68.7 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  66.92 
 
 		 267 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  66.92 
 
 		 267 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  66.41 
 
 		 267 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  66.54 
 
 		 267 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  66.54 
 
 		 267 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  67.18 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  66.16 
 
 		 269 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  63.5 
 
 		 267 aa  363  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  61.83 
 
 		 271 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  60.08 
 
 		 266 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  54.26 
 
 		 265 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  50.57 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  48.84 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  49.43 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  50.19 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  50.76 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  48.06 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  48.84 
 
 		 264 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  48.45 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  49.81 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  48.83 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  48.83 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  48.83 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  48.44 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  48.44 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  48.06 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  45 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  49.43 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  50.38 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  46.15 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  45.77 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  45.77 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  45.77 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  45.77 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  45.77 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  45.77 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  45.77 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  45.77 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  46.92 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  47.27 
 
 		 264 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  45.38 
 
 		 270 aa  251  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  46.15 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  45.74 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  43.61 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  45 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  45 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  46.07 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  40.68 
 
 		 265 aa  234  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  44.02 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  42.37 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  41.29 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  36.12 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  34.98 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  33.97 
 
 		 464 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  35.52 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.75 
 
 		 606 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.85 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.23 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  37.93 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  32.57 
 
 		 458 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 457 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  31.8 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 		 458 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.18 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  32.95 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.18 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.8 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  31.18 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.25 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  31.8 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  31.8 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.8 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  34.01 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  34.57 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.8 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  44.94 
 
 		 179 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  32.93 
 
 		 459 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.84 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  35.1 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.8 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  34.35 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>