More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0315 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  100 
 
 		 260 aa  542  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 		 458 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 		 458 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.08 
 
 		 606 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.46 
 
 		 457 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 462 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  40.47 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.47 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.3 
 
 		 464 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 461 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  38.11 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  38.11 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  38.11 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  38.11 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  37.74 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  39.23 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  40.87 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  40.15 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  38.93 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  38.78 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  38.93 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  38.78 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  38.93 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  38.93 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  41.91 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  39.06 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  35.98 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  40.48 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  38.93 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  35.25 
 
 		 264 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  42.21 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  38.08 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.43 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  38.08 
 
 		 264 aa  174  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  38.55 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  41.91 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  34.6 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  41.39 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  36.92 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  41.84 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  39.53 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  38.95 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  41.06 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  38.74 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  40.8 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  40.8 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.11 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  39.76 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  39.15 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  38.93 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  37.74 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  39.08 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  39.23 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  36.88 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  38.7 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  34.69 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  42.5 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  35.02 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  37.64 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  37.31 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  36.68 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  35.92 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  39.15 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  38.13 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  39.15 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  39.3 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  35.77 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.19 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  39.62 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.19 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  41.49 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  35.52 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  38.08 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  38.26 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  36.29 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.41 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.41 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.5 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.41 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.41 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.92 
 
 		 459 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>