More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2255 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  93.77 
 
 		 273 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  81.27 
 
 		 268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  73.41 
 
 		 275 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  75.47 
 
 		 289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  75.09 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  77.53 
 
 		 267 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  75.38 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  72.28 
 
 		 270 aa  384  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  77.15 
 
 		 267 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  73.86 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  51.91 
 
 		 265 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  48.66 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  56.23 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  55.85 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  48.88 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  47.73 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  52.79 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  52.79 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  47.35 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  47.35 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  47.35 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  48.85 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  48.85 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  52.45 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  48.66 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  47.51 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  50.38 
 
 		 266 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  48.85 
 
 		 264 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  47.51 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  48.85 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  48.47 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  47.13 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  54.98 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  49.62 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  46.74 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  45.98 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  48.29 
 
 		 267 aa  259  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  47.51 
 
 		 267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  51.53 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  47.53 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  48.47 
 
 		 260 aa  255  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  52.81 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  46.18 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  45.8 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  45.8 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  45.8 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  45.63 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  45.8 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  49.23 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  48.47 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  48.47 
 
 		 264 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  44.91 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  45.42 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  48.47 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  45.42 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  45.25 
 
 		 264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  47.79 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  49.44 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  41.79 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  40.8 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  46.44 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  40.91 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  40.48 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  39.7 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.58 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.32 
 
 		 462 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.85 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  46.88 
 
 		 179 aa  148  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.46 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.7 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  34.34 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 		 264 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.21 
 
 		 458 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  35.19 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.84 
 
 		 462 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.84 
 
 		 606 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  31.84 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.11 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  34.98 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.23 
 
 		 457 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  32.93 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  37.26 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  33.97 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.2 
 
 		 464 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  28.63 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  35.36 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  34.6 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  35.29 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  30.15 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  30.97 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  28.79 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  35.36 
 
 		 461 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  32.2 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  30.92 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  33.71 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  31.54 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  31.54 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.54 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>