More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4217 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 262 aa  544  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  48.09 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  42.37 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  46.44 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  45.68 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  47.26 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  43.31 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  46.03 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  41.96 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  45.7 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  45.7 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  45.7 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  45.7 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  47.86 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  43.68 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  46.84 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  46.41 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  41.57 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  45.31 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  41.57 
 
 		 267 aa  210  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  38.85 
 
 		 264 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  41.57 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  41.25 
 
 		 270 aa  208  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  42.62 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  42.53 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  42.53 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  43.37 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  46.44 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  42.44 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  43.3 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  42.91 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  46.03 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  42.91 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  42.91 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  42.91 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  35.85 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  45.19 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  42.53 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  42.97 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  40 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  44.17 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  42.53 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  42.53 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  46.78 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  43.15 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  41.15 
 
 		 265 aa  198  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  38.91 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  45.49 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  41.18 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  37.79 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  45.49 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  42.23 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  44.35 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  42.55 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  36.15 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.7 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.66 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  36.03 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  36.07 
 
 		 461 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.52 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.98 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36 
 
 		 606 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  38.26 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  35.63 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 462 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.44 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  35.22 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  35.1 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  34.02 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.92 
 
 		 462 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  34.82 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.57 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.56 
 
 		 464 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  32.65 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.63 
 
 		 458 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  34.29 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.21 
 
 		 458 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  31.58 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.44 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.48 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  33.88 
 
 		 459 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  32.8 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.99 
 
 		 457 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  31.13 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  30.17 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  30.99 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  32.68 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.64 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>