More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2443 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  74.53 
 
 		 268 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  73.41 
 
 		 278 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  73.03 
 
 		 273 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  72.76 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  76.78 
 
 		 267 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  73.58 
 
 		 265 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  73.58 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  76.4 
 
 		 267 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  72.73 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  72.73 
 
 		 265 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  53.26 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  52.67 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  50.57 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  51.72 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  52.69 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  52.69 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  51.72 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 		 262 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  51.34 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  52.69 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  52.31 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  54.72 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  52.31 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  51.34 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  51.32 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  51.32 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  51.7 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  50.95 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  55.73 
 
 		 287 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  51.91 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  50.57 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  50.57 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  50.76 
 
 		 266 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  50.19 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  49.24 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  49.24 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  48.67 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  48.67 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  48.85 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  50.19 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  48.85 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  48.85 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  49.43 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  51.34 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  48.47 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  48.47 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  48.51 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  52.29 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  50.76 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  50.38 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  50 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  52.83 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  47.17 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  53.26 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  48.69 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  51.54 
 
 		 264 aa  244  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  48.85 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  48.85 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  44.4 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  47.86 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  40.46 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  40.15 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  40.82 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.23 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  38.74 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.95 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  35.9 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.95 
 
 		 464 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.98 
 
 		 462 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  34.57 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.09 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  34.09 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  45.96 
 
 		 179 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  35.36 
 
 		 461 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.33 
 
 		 458 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  31.17 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  31.84 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.33 
 
 		 458 aa  141  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  37.26 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  36.88 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  36.88 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  34.08 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.73 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.26 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.08 
 
 		 606 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  33.84 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  30.15 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  32.58 
 
 		 457 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  33.86 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  30.53 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  33.86 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  29.63 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  30.15 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  32.7 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  30.53 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>