More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2211 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
258 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  46.72 
 
 
265 aa  252  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  47.08 
 
 
260 aa  251  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  45.91 
 
 
260 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  46.9 
 
 
262 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  44.19 
 
 
264 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  44.19 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  44.19 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  44.19 
 
 
264 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  44.19 
 
 
264 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  44.57 
 
 
260 aa  240  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  44.19 
 
 
264 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  44.19 
 
 
264 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  44.19 
 
 
260 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  44.19 
 
 
260 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  44.19 
 
 
260 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  44.19 
 
 
260 aa  238  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  44.19 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  44.19 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  43.46 
 
 
264 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  44.19 
 
 
264 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  44.96 
 
 
267 aa  234  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  44.96 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  45.53 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  44.96 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  45.53 
 
 
260 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 
269 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  45.35 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  44.19 
 
 
267 aa  232  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  41.86 
 
 
267 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  43.02 
 
 
267 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  43.92 
 
 
287 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 
267 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 
267 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  43.19 
 
 
260 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 
267 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  44.57 
 
 
266 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  42.8 
 
 
266 aa  221  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  41.25 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  42.69 
 
 
271 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  42.53 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  40.86 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  45.12 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  41.76 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  44.67 
 
 
264 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  44.72 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  40.46 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  40.8 
 
 
278 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  40.08 
 
 
270 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  41.76 
 
 
267 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  46.06 
 
 
271 aa  205  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 
268 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  40.59 
 
 
270 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  42.26 
 
 
268 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  41.84 
 
 
267 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  39.77 
 
 
268 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  37.26 
 
 
265 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  38.67 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  36.15 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  35.8 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  34.38 
 
 
256 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  34.1 
 
 
261 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.52 
 
 
255 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.52 
 
 
255 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.52 
 
 
255 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.52 
 
 
255 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.73 
 
 
268 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.75 
 
 
255 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 
457 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.75 
 
 
255 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.5 
 
 
257 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.55 
 
 
256 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.75 
 
 
255 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  34.36 
 
 
264 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.85 
 
 
255 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.05 
 
 
257 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  34.63 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  32.94 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.63 
 
 
462 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.68 
 
 
464 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.75 
 
 
255 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.14 
 
 
255 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.85 
 
 
256 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  32.82 
 
 
461 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  35.94 
 
 
255 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  31.76 
 
 
263 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
255 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  32.43 
 
 
263 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.25 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.63 
 
 
462 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.41 
 
 
606 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  34.1 
 
 
266 aa  151  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  34.63 
 
 
261 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  32.94 
 
 
260 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
458 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>