More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4206 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  100 
 
 		 267 aa  554  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  92.48 
 
 		 267 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  92.11 
 
 		 267 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  91.39 
 
 		 267 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  82.77 
 
 		 267 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  84.47 
 
 		 267 aa  470  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  84.09 
 
 		 267 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  84.09 
 
 		 267 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  84.09 
 
 		 267 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  70.99 
 
 		 264 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  69.29 
 
 		 267 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  67.18 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  69.47 
 
 		 262 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  69.47 
 
 		 269 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  64.15 
 
 		 271 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  62.6 
 
 		 266 aa  323  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  53.85 
 
 		 265 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  50.96 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  50.57 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  49.04 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  46.9 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  49.04 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  48.66 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  50.19 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  47.89 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  48.26 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  47.51 
 
 		 278 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  48.84 
 
 		 260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  47.88 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  47.88 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  47.88 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  47.88 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  47.88 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  47.88 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  47.88 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  48.45 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  48.08 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  48.67 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  47.88 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  47.88 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  50.76 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  48.68 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  47.29 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  47.88 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  47.69 
 
 		 267 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  47.1 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  45.98 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  45.38 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  43.13 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  45.38 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  45.35 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  45.35 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  44.27 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  44.49 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  45.35 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  45.35 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  42.05 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  43.46 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  42.69 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  40.77 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.98 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34.62 
 
 		 464 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.5 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.09 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  34.47 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35 
 
 		 606 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  33.96 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.54 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  34.09 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  31.42 
 
 		 458 aa  148  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.38 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  33.71 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  35.19 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  33.74 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.71 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  34 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.26 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.56 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  36.03 
 
 		 461 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.96 
 
 		 457 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.56 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.56 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.56 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.56 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  35.11 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  31.03 
 
 		 458 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.11 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.78 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.56 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  34.19 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>