More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4694 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 271 aa  544  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  50.94 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  50.58 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  49.42 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  53.58 
 
 		 273 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  52.94 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  53.18 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  48.87 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  48.87 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  52.57 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  49.26 
 
 		 267 aa  271  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  54.75 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  54.96 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  53.21 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  55.02 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  51.91 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 269 aa  268  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  52.11 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  51.91 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  48.48 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  51.91 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  51.72 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  52.27 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  47.53 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  48.68 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  52.69 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  54.68 
 
 		 265 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  48.87 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  47.15 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  47.15 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  47.15 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  49.62 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  51.72 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  50.38 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  53.93 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  51.72 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  54.92 
 
 		 267 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  52.45 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  55.38 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  50.38 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  50.38 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  50.38 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  50.38 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  50 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  50 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  50 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  46.74 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  50.38 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  49.62 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  52.08 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  49.04 
 
 		 260 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  47.55 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  54.17 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  54.1 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  48.46 
 
 		 264 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  47.15 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  51.31 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  46.18 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  41.06 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.75 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.32 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.31 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  39.39 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  49.39 
 
 		 179 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  34.23 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.54 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.23 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.66 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  31.56 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.34 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.62 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  33.85 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  33.46 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.73 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.46 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.31 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  32.69 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  34.2 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  33.08 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.08 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  33.08 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.69 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.15 
 
 		 457 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  36.88 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.69 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  38.55 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  37.08 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  38.87 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  34.57 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>