More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3380 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  71.48 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  72.52 
 
 		 262 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  72.62 
 
 		 267 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  71.86 
 
 		 267 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  72.08 
 
 		 267 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  71.86 
 
 		 267 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  72.24 
 
 		 267 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  70.99 
 
 		 267 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  70.61 
 
 		 267 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  70.61 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  69.47 
 
 		 267 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  67.8 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  66.16 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  64.12 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  63.12 
 
 		 266 aa  328  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  53.49 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  51.72 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  52.9 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  51.91 
 
 		 275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  50.78 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  50.78 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  50.78 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  50.78 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  50.39 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  48.66 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  50.57 
 
 		 265 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  48.66 
 
 		 268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  49.61 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  47.67 
 
 		 266 aa  258  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  49.22 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  49.22 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  49.22 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  49.22 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  49.22 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  49.22 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  50.77 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  48.84 
 
 		 260 aa  255  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  49.22 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  50.19 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  48.26 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  47.67 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  50.38 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  49.22 
 
 		 264 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  47.29 
 
 		 260 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  52.11 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  48.54 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  44.57 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  45.95 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  47.28 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  47.37 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  45.74 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  43.94 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  43.8 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  43.8 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  44.96 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  43.75 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  42.48 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.92 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  37.19 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  35.23 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.22 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.52 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.21 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.11 
 
 		 464 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  35 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  35.43 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.36 
 
 		 457 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.07 
 
 		 606 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  35.37 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  36.56 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  33.47 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.84 
 
 		 462 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.43 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  33.06 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  33.72 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.05 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  35.51 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.78 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.05 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.05 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.05 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.05 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 462 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.66 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.05 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  34.35 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  35.86 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.66 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>