More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3909 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  100 
 
 
264 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  76.36 
 
 
260 aa  424  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  76.52 
 
 
264 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  75.58 
 
 
260 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  72.48 
 
 
260 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  72.09 
 
 
260 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  72.09 
 
 
260 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  68.48 
 
 
264 aa  364  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  66.54 
 
 
260 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  66.93 
 
 
260 aa  359  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  66.54 
 
 
264 aa  358  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  66.54 
 
 
260 aa  357  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  66.54 
 
 
260 aa  357  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  66.54 
 
 
260 aa  357  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  66.54 
 
 
260 aa  357  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  66.15 
 
 
264 aa  357  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  66.15 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  66.15 
 
 
264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  65.76 
 
 
264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  66.15 
 
 
264 aa  355  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  66.15 
 
 
260 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  66.15 
 
 
260 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  52.49 
 
 
265 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  50.37 
 
 
270 aa  280  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 
266 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  47.27 
 
 
264 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 
271 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  53.1 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  47.27 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  50.57 
 
 
289 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  49.23 
 
 
278 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  48.85 
 
 
273 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  45.7 
 
 
264 aa  245  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  51.54 
 
 
275 aa  244  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  50.19 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  47.71 
 
 
271 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  52.44 
 
 
273 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  49.62 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  50.41 
 
 
267 aa  238  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 
267 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  50.77 
 
 
270 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 
267 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  50.62 
 
 
270 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  52.28 
 
 
264 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  46.09 
 
 
267 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  46.3 
 
 
267 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  46.3 
 
 
267 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  46.01 
 
 
268 aa  235  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  46.01 
 
 
268 aa  234  8e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  52.51 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  45.14 
 
 
267 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  43.35 
 
 
267 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  65.45 
 
 
179 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  43.85 
 
 
267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  53.11 
 
 
265 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  42.97 
 
 
267 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  43.75 
 
 
269 aa  225  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  48.46 
 
 
271 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  42.69 
 
 
267 aa  222  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  43.41 
 
 
266 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  51.42 
 
 
267 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 
258 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  44.14 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  39 
 
 
265 aa  205  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  45.49 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1906  deoxyribonuclease TatD  79 
 
 
111 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.56 
 
 
256 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 
261 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  36.58 
 
 
256 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  34.48 
 
 
264 aa  151  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.09 
 
 
606 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.08 
 
 
462 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 
256 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  31.13 
 
 
257 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.15 
 
 
256 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  32.68 
 
 
257 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 
258 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  34.1 
 
 
261 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
260 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.66 
 
 
457 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.8 
 
 
464 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.6 
 
 
462 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  29.57 
 
 
256 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  30.38 
 
 
264 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  29.57 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  32.95 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  32.05 
 
 
253 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  29.34 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 
458 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 
458 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  29.18 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  28.96 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.18 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  28.4 
 
 
255 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  29.18 
 
 
255 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.79 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.79 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>