More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4140 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 260 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  100 
 
 		 260 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  99.62 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  99.62 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  99.62 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  99.62 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  98.85 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  98.08 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  98.08 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  81.92 
 
 		 260 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  81.54 
 
 		 264 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  81.92 
 
 		 264 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  81.92 
 
 		 264 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  81.54 
 
 		 260 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  74.62 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  69.62 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  69.23 
 
 		 260 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  68.34 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  66.54 
 
 		 260 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  66.54 
 
 		 260 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  66.15 
 
 		 264 aa  354  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  65.37 
 
 		 264 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  51.34 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  49.42 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  51.36 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  51.16 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  49.03 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  51.16 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  49.03 
 
 		 267 aa  265  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  48.08 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  48.84 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  48.45 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  48.45 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  45.77 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  48.45 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  49.22 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  48.47 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  47.49 
 
 		 267 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 289 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  51.02 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  51.87 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  45.42 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  49.79 
 
 		 264 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  47.71 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  46.39 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  45.95 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  44.4 
 
 		 266 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  45.95 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  45.42 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  44.19 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  44.27 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  47.51 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  50.21 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  50.82 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  45.74 
 
 		 267 aa  235  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  49.38 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  47.51 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  45.95 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  47.55 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  64.24 
 
 		 179 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.77 
 
 		 464 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 462 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.31 
 
 		 606 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.91 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  38.55 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 		 458 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.36 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  36.02 
 
 		 462 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.05 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.15 
 
 		 457 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.66 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  35.12 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  36.6 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  32.18 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  34.75 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.92 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.87 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 261 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  34.11 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.15 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.35 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  33.98 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 459 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  33.72 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  34.87 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.35 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.35 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  36.92 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.35 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>