More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4103 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 264 aa  550  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  76.72 
 
 		 262 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  74.43 
 
 		 267 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  72.52 
 
 		 267 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  73.28 
 
 		 267 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  72.14 
 
 		 267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  72.9 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  72.14 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  72.14 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  71.37 
 
 		 267 aa  400  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  70.99 
 
 		 267 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  71.48 
 
 		 269 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  68.06 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  68.7 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  61.74 
 
 		 271 aa  348  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  62.36 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  54.26 
 
 		 265 aa  298  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  53.26 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  52.11 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  52.11 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  51.74 
 
 		 264 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  49.05 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  48.66 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  51.15 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  49.61 
 
 		 270 aa  272  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  49.23 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  46.92 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  48.85 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  49.62 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  52.11 
 
 		 265 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  48.46 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  48.46 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  48.46 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  48.46 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  48.84 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  49.03 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  48.46 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  48.08 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  48.08 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  47.89 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  48.44 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  48.44 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  48.44 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  49.42 
 
 		 271 aa  261  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  47.29 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  48.05 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  48.05 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  47.67 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  47.33 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  46.12 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  46.12 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  45.7 
 
 		 264 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  46.44 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  44.96 
 
 		 287 aa  241  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  43.46 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  43.02 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  43.02 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  42.21 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  39.92 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  38.85 
 
 		 262 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.08 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.29 
 
 		 464 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.85 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.89 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  35.25 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.29 
 
 		 606 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.14 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.62 
 
 		 462 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.69 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  35.12 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  34.35 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  33.84 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.59 
 
 		 459 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.93 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.82 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.98 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.43 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.05 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.05 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.05 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.05 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  31.4 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  32.57 
 
 		 458 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.34 
 
 		 457 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.27 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 258 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 		 458 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  31.66 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.05 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  31.66 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  35.92 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  32.43 
 
 		 462 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  33.21 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>