More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03776 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  87.45 
 
 
267 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  77.19 
 
 
268 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  76.81 
 
 
268 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  56.98 
 
 
268 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  55.85 
 
 
278 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  57.74 
 
 
289 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  57.89 
 
 
270 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  54.72 
 
 
275 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  55.47 
 
 
273 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  56.98 
 
 
265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  58.62 
 
 
287 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  57.3 
 
 
267 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  56.82 
 
 
264 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  49.61 
 
 
264 aa  275  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  49.43 
 
 
267 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  50 
 
 
267 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  50 
 
 
267 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  51.72 
 
 
266 aa  271  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  57.95 
 
 
265 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  57.95 
 
 
267 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  48.45 
 
 
267 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  48.06 
 
 
267 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  48.67 
 
 
267 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  48.06 
 
 
267 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  50.19 
 
 
264 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  48.06 
 
 
267 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  54.95 
 
 
273 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  50.97 
 
 
260 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  49.81 
 
 
264 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  55.69 
 
 
271 aa  259  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  50.97 
 
 
260 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  49.81 
 
 
264 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  47.29 
 
 
262 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  50.78 
 
 
264 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  50.97 
 
 
260 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  50.97 
 
 
260 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  49.81 
 
 
260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  50.39 
 
 
264 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  48.65 
 
 
260 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  49.81 
 
 
264 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  46.72 
 
 
265 aa  258  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  50.58 
 
 
260 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  49.42 
 
 
260 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  51.74 
 
 
260 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  50.83 
 
 
267 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  50.58 
 
 
260 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  49.26 
 
 
271 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  47.13 
 
 
271 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  47.88 
 
 
260 aa  255  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  50.58 
 
 
260 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  46.15 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  48.11 
 
 
270 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  49.42 
 
 
260 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  49.42 
 
 
260 aa  249  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  45.35 
 
 
267 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  46.9 
 
 
269 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  44.87 
 
 
265 aa  245  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  48.84 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  49.22 
 
 
264 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  44.66 
 
 
266 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  45.99 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  39.45 
 
 
258 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  42.44 
 
 
262 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  43.66 
 
 
264 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.42 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.13 
 
 
464 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.87 
 
 
255 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
257 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
257 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  42.4 
 
 
260 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.45 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.84 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  38.17 
 
 
459 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.64 
 
 
257 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.61 
 
 
256 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  36.88 
 
 
462 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.72 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
257 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.07 
 
 
256 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  32.43 
 
 
256 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.53 
 
 
458 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  37.26 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 
457 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  36.26 
 
 
258 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.43 
 
 
462 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
256 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  36.26 
 
 
258 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  37.41 
 
 
263 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  35.23 
 
 
259 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.3 
 
 
255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.68 
 
 
255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.3 
 
 
255 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.3 
 
 
255 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.3 
 
 
255 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.3 
 
 
255 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.91 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>