More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  92.48 
 
 		 267 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  77.15 
 
 		 278 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  76.4 
 
 		 275 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  75.66 
 
 		 273 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  75.28 
 
 		 268 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  74.53 
 
 		 270 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  74.72 
 
 		 289 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  73.96 
 
 		 265 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  74.62 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  73.48 
 
 		 265 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  52.49 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  57.95 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  55.68 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  54.17 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  50.38 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  53.79 
 
 		 268 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  57.85 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  48.85 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  48.46 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  50.58 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  50.58 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  48.46 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  50.58 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  50.58 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  50.38 
 
 		 269 aa  261  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  48.08 
 
 		 267 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  48.08 
 
 		 267 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  48.68 
 
 		 270 aa  261  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  50 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  47.69 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  47.69 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  50.19 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  48.08 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  48.85 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  47.31 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  57.04 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  47.69 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  50.57 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  48.28 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  47.89 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  47.71 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  47.89 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  47.89 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  47.71 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  48.67 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  47.89 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  51.34 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  49.43 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  47.51 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  47.51 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  54.17 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  50.19 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  46.92 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  49.43 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  49.43 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  45.08 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  48.67 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  46.99 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  45.49 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  39.16 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.11 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.36 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  38.06 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.33 
 
 		 464 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  48.75 
 
 		 179 aa  148  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.23 
 
 		 256 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.94 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  38.2 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  32.58 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  31.15 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.71 
 
 		 462 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.46 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  34.59 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 		 458 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 		 458 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 		 457 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  36.74 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  36.98 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  36.98 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  31.3 
 
 		 462 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  32.7 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  38.74 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  30.5 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  33.21 
 
 		 459 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.59 
 
 		 606 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  29.32 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.16 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  35.66 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  33.09 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.12 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>