More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0317 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 265 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  55.51 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  55.38 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  57.36 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  54.23 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  54.05 
 
 		 264 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  54.05 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  54.05 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  54.05 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  53.67 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  54.41 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  53.85 
 
 		 260 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  54.26 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  54.83 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  53.46 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  54.02 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  54.02 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  52.49 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  52.9 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  53.46 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  53.67 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  53.46 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  53.46 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  53.46 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  53.46 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  53.85 
 
 		 267 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  54.26 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 267 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  51.92 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  53.85 
 
 		 267 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 267 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  53.46 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  53.28 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 267 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  53.49 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  53.41 
 
 		 271 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  52.67 
 
 		 275 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  54.2 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  53.26 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  53.44 
 
 		 265 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  51.91 
 
 		 278 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  53.44 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  51.74 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  51.53 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  51.91 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  54.96 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  50.57 
 
 		 267 aa  275  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  50.76 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  50.94 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  52.49 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  54.2 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  48.29 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  46.56 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  46.33 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  47.49 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  46.72 
 
 		 258 aa  252  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  46.72 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  45.8 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  45.8 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  46.64 
 
 		 273 aa  235  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  44.49 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  41.15 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  55.76 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  39.16 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  34.87 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  39.16 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.69 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.52 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.78 
 
 		 606 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34.48 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  35.61 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.54 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  33.2 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.2 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.82 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.98 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.82 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.98 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.25 
 
 		 462 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.43 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  32.43 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.43 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  32.43 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.38 
 
 		 457 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.73 
 
 		 462 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.62 
 
 		 458 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.62 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  34.23 
 
 		 461 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  30.5 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  33.85 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.27 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  33.08 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>