More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2399 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  100 
 
 
287 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  51.74 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  57.47 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  57.47 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  53.88 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  58.33 
 
 
270 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  59.85 
 
 
267 aa  282  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  53.49 
 
 
264 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  53.49 
 
 
260 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  53.49 
 
 
260 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  56.23 
 
 
278 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  55.73 
 
 
275 aa  278  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  56.49 
 
 
268 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  53.1 
 
 
264 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  52.34 
 
 
260 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  54.62 
 
 
260 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  53.03 
 
 
271 aa  276  4e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  51.95 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  51.95 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  58.62 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  51.95 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  54.05 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  51.95 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  51.95 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  56.87 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  51.16 
 
 
260 aa  271  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  51.16 
 
 
260 aa  271  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  54.34 
 
 
273 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  51.56 
 
 
264 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  56.49 
 
 
265 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  59.77 
 
 
267 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  54.3 
 
 
264 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  52.51 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  51.91 
 
 
264 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  52.9 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  53.28 
 
 
260 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  53.28 
 
 
260 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  55.73 
 
 
264 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  53.1 
 
 
264 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 
262 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  57.85 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 
264 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  56.49 
 
 
265 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  53.38 
 
 
273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  55.38 
 
 
271 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  45.95 
 
 
269 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  44.06 
 
 
270 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 
264 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  43.92 
 
 
258 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  42.97 
 
 
267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  44.4 
 
 
267 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  44.4 
 
 
267 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  43.46 
 
 
267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 
267 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 
267 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  43.46 
 
 
267 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  45.56 
 
 
267 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  43.46 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  41.54 
 
 
265 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 
267 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  45.56 
 
 
266 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  42.25 
 
 
271 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  43.37 
 
 
262 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  40.38 
 
 
258 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  40.93 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  53.75 
 
 
179 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.92 
 
 
256 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.08 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.09 
 
 
464 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.74 
 
 
264 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 
256 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
261 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.45 
 
 
264 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  41.15 
 
 
261 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  37.55 
 
 
264 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  32.82 
 
 
255 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.16 
 
 
267 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.63 
 
 
606 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.43 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 
262 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 
457 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.43 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.43 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.43 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.43 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.43 
 
 
255 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.82 
 
 
255 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35 
 
 
459 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  32.05 
 
 
255 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.08 
 
 
462 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.05 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  37.35 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.89 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  36.68 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  31.64 
 
 
255 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 
257 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 
257 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.64 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.87 
 
 
462 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>