More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4050 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  100 
 
 		 260 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  92.31 
 
 		 260 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  76.36 
 
 		 264 aa  424  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  74.13 
 
 		 260 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  74.13 
 
 		 260 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  74.9 
 
 		 260 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  71.15 
 
 		 264 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  70 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  70 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  70 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  70 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  70.38 
 
 		 260 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  70 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  69.62 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  69.62 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  68.73 
 
 		 260 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  69.62 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  68.73 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  68.34 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  68.73 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  68.73 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  69.65 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  54.23 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  54.79 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  52.53 
 
 		 266 aa  278  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  51.55 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  48.06 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  52.51 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  48.09 
 
 		 273 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  48.47 
 
 		 278 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  47.49 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  47.49 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  50.38 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  49.79 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 289 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  47.88 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  49.62 
 
 		 265 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  45.91 
 
 		 258 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  46.72 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  47.29 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  46.33 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  46.33 
 
 		 267 aa  245  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  46.9 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  46.33 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 267 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 267 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  47.1 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  48.09 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  48.09 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  51.63 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  43.63 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  45.74 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  47.53 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  49.79 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  68.48 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  49.43 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  51.03 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 271 aa  228  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  45.56 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  50.2 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  38.22 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1906  deoxyribonuclease TatD  79 
 
 		 111 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  34.1 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.17 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.29 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  36.19 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.23 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.08 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.02 
 
 		 459 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.69 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 261 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 457 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.02 
 
 		 606 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.06 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.89 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  32.82 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.98 
 
 		 462 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.8 
 
 		 464 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.48 
 
 		 462 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 		 458 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 		 458 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.8 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  30.74 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  30.74 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.13 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  31.13 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.13 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  30.74 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  34.6 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  31.13 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  30.35 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  30.35 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>