More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1906 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1906  deoxyribonuclease TatD  100 
 
 		 111 aa  226  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  99.03 
 
 		 260 aa  213  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  99.03 
 
 		 260 aa  212  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  83.17 
 
 		 260 aa  181  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  77.67 
 
 		 260 aa  175  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  79 
 
 		 260 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  79 
 
 		 264 aa  166  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  78 
 
 		 264 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  67 
 
 		 264 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  67 
 
 		 264 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  67 
 
 		 260 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  66 
 
 		 264 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  66 
 
 		 260 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  64.36 
 
 		 260 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  64.36 
 
 		 260 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  64.36 
 
 		 260 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  64.36 
 
 		 260 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  64.36 
 
 		 260 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  64.36 
 
 		 260 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  64.36 
 
 		 264 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  64.36 
 
 		 260 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  62.38 
 
 		 264 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  65.62 
 
 		 264 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  51.96 
 
 		 264 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  53 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  52.58 
 
 		 270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  53.92 
 
 		 266 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  49.02 
 
 		 262 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  48.04 
 
 		 265 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  54.55 
 
 		 271 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  48.48 
 
 		 267 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  48.48 
 
 		 267 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  50.96 
 
 		 287 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  49.02 
 
 		 266 aa  104  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  48.48 
 
 		 267 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  47.47 
 
 		 267 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  56.82 
 
 		 268 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  52.53 
 
 		 258 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  51.96 
 
 		 270 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  47.47 
 
 		 267 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  56.82 
 
 		 268 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  52.04 
 
 		 273 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  46.08 
 
 		 264 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  48.7 
 
 		 289 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 267 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  54.08 
 
 		 275 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  48.51 
 
 		 271 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  48.7 
 
 		 265 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  53.19 
 
 		 278 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 267 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 267 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 267 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 267 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  54 
 
 		 270 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  53.12 
 
 		 265 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  58.33 
 
 		 267 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  46.08 
 
 		 258 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  50 
 
 		 267 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 264 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  55.43 
 
 		 273 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  43.88 
 
 		 269 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  48.98 
 
 		 268 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  53.57 
 
 		 267 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  46.91 
 
 		 262 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  43.3 
 
 		 260 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  35 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.23 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.23 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 		 263 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  33 
 
 		 255 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  29.47 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.95 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  32 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  32.29 
 
 		 256 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  32 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  33.68 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  36.84 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  32.99 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  32.99 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  32.99 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  32.99 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  34.02 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  32.99 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  39.82 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  32.99 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  32.99 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  34.62 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.78 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  35 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  36.46 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  32.99 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  31.58 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  33.66 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  36.84 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 459 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1996  TatD-related deoxyribonuclease  40.38 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  34.55 
 
 		 252 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  37.11 
 
 		 253 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  34.74 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  28.42 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>